Por serem produtos químicos, os desinfetantes requerem atenção especial no local de armazenamento. Geralmente, os desinfetantes devem ser armazenados em um local bem-ventilado e seco, longe da luz solar direta e do acesso de crianças, como um local fresco e seco, como um depósito, armário ou caixa. Além disso, devem ser mantidos longe de alimentos e bebidas para evitar ingestão acidental ou uso indevido. Se o desinfetante for líquido, deve ser armazenado em recipiente lacrado para evitar vazamentos. Ao armazenar, deve ser mantido separado de outros produtos químicos para evitar acidentes.
